合浦珠母贝cDNA-SNP分型及其与性状关联研究

成果基本信息
关键词：	合浦珠母贝;转录组;表型性状;cDNA-SNP分型
成果类别：		技术成熟度：
体现形式（基础理论类）：		体现形式（应用技术类）：	无
成果登记号：	4602018J0073	资源采集日期：	2019-03-15

研究情况
单位名称：	中国水产科学研究院南海水产研究所热带水产研究开发中心	技术水平：
评价证书号：	琼科函[2017]456号	评价单位：	海南省科学技术厅
评价日期：	2017.06.13	评价证书号：	琼科函[2017]456号

转化情况
转让范围：		推广形式：	无
已转让企业数（个）：	0

联系方式
联系人（平台）：	玉女士	联系人（平台）电话：	0771-5885053
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成果简介
1、课题来源与背景：　　来源：2015海南省自然科学基金项目；　　背景：经过多年的养殖，合浦珠母贝性状退化，个体小，死亡率高，迫切需要遗传改良。目前合浦珠母贝的基因资源十分缺乏，与性状关联的分子标记很少。　　2、研究目的与意义：　　本研究拟对合浦珠母贝转录组测序结果得到的SNP候选位点进行鉴定和分型，并与生长性状做关联分析，获得与之相关的SNP标记，从而推进合浦珠母贝遗传选育进程。　　3、主要论点与论据：　　（1）从转录组测序结果中筛选出候选SNP位点。　　（2）基于HRM技术对候选SNP位点进行鉴定和分型。　　（3）SNP位点的生物信息学分析。　　（4）SNP位点与生长性状（如壳长、绞合线长、壳宽、壳高、体重、壳干湿重、内脏团干湿重、壳厚、壳强度、闭壳肌拉力等）的关联分析。　　4、创见与创新：　　目前，合浦珠母贝遗传选育多依赖于表型性状。表型性状容易受到环境的影响。遗传信息是稳定的，可用于辅助选育。哪些SNP位点与性状相关，其分子机制是什么，值得关注。　　5、社会经济效益，存在的问题：　　本研究筛选出来的SNP位点可为合浦珠母贝生长、抗逆、繁育等性状解析和遗传选育研究奠定了一定的基础。　　6、历年获奖情况：　　获得2016年海洋科学技术奖二等奖一项。　　喻达辉、范嗣刚、黄桂菊、郭奕惠、刘宝锁、陈明强、李有宁、吴开畅、张博、姜松，合浦珠母贝良种选育技术，国家海洋局，海洋科学技术奖，二等奖. 2016.4. 　　7、成果简介：　　本项目顺利完成了各项指标。基于合浦珠母贝转录组数据鉴定出SNP位点250，324个，用HRM技术筛选出可用SNP位点203个，成功注释126个，其中包含一些与生长、抗逆、繁育等性状相关的功能基因。有6个SNP与合浦珠母贝生长性状相关。本研究发表论文3篇，其中SCI收录2篇，中文核心1篇。获得2016年海洋科学技术奖二等奖一项。

成果名称：	合浦珠母贝cDNA-SNP分型及其与性状关联研究	关键词：	合浦珠母贝;转录组;表型性状;cDNA-SNP分型
成果类别：		一级分类名称：	农业生物技术
二级分类名称：	水产养殖	三级分类名称：
研究起止时间：	2015.01 至2016.12	成果体现形式（应用技术类）：	无
成果属性：		成果体现形式（基础理论类）：
技术成熟度：		技术水平：
研究形式：		学科分类1：
单位名称：	中国水产科学研究院南海水产研究所热带水产研究开发中心	学科分类2：
中图分类号1：		所属高新技术类别：
中图分类号2：		课题来源：
应用行业：		课题立项名称：
国家科技计划子类别：		课题立项编号：	20154180
经费实际投入额（万元）：	6.00	评价单位：	海南省科学技术厅
评价形式：	无	应用状态：	无
评价日期：	2017.06.13	转让范围：
评价证书号：	琼科函[2017]456号	推荐单位：	中国水产科学研究院南海水产研究所热带水产研究开发中心
推广形式：	无	成果登记号：	4602018J0073
成果简介：	1、课题来源与背景：　　来源：2015海南省自然科学基金项目；　　背景：经过多年的养殖，合浦珠母贝性状退化，个体小，死亡率高，迫切需要遗传改良。目前合浦珠母贝的基因资源十分缺乏，与性状关联的分子标记很少。　　2、研究目的与意义：　　本研究拟对合浦珠母贝转录组测序结果得到的SNP候选位点进行鉴定和分型，并与生长性状做关联分析，获得与之相关的SNP标记，从而推进合浦珠母贝遗传选育进程。　　3、主要论点与论据：　　（1）从转录组测序结果中筛选出候选SNP位点。　　（2）基于HRM技术对候选SNP位点进行鉴定和分型。　　（3）SNP位点的生物信息学分析。　　（4）SNP位点与生长性状（如壳长、绞合线长、壳宽、壳高、体重、壳干湿重、内脏团干湿重、壳厚、壳强度、闭壳肌拉力等）的关联分析。　　4、创见与创新：　　目前，合浦珠母贝遗传选育多依赖于表型性状。表型性状容易受到环境的影响。遗传信息是稳定的，可用于辅助选育。哪些SNP位点与性状相关，其分子机制是什么，值得关注。　　5、社会经济效益，存在的问题：　　本研究筛选出来的SNP位点可为合浦珠母贝生长、抗逆、繁育等性状解析和遗传选育研究奠定了一定的基础。　　6、历年获奖情况：　　获得2016年海洋科学技术奖二等奖一项。　　喻达辉、范嗣刚、黄桂菊、郭奕惠、刘宝锁、陈明强、李有宁、吴开畅、张博、姜松，合浦珠母贝良种选育技术，国家海洋局，海洋科学技术奖，二等奖. 2016.4. 　　7、成果简介：　　本项目顺利完成了各项指标。基于合浦珠母贝转录组数据鉴定出SNP位点250，324个，用HRM技术筛选出可用SNP位点203个，成功注释126个，其中包含一些与生长、抗逆、繁育等性状相关的功能基因。有6个SNP与合浦珠母贝生长性状相关。本研究发表论文3篇，其中SCI收录2篇，中文核心1篇。获得2016年海洋科学技术奖二等奖一项。
联系人：	王雨	成果登记日期：	2018-02-13
联系人email：	winterrose@163.com	单位代码：	94600416
邮政编码222：	572018	联系人电话：	0898-83361232
单位传真：	0898-88599073	单位通讯地址：	海南省三亚市安游六道路4号
单位所在省市：		单位电话：	0898-88599073
转让收入（万元）：	0	单位属性：
合作完成单位：		已转让企业数（个）：	0
成果发布年份：	2018	知识产权形式：
成果完成人：	范嗣刚;刘宝锁;吴开畅;喻达辉;黄桂菊;郭奕惠	资源采集日期：	2019-03-15

合浦珠母贝cDNA-SNP分型及其与性状关联研究

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