复杂性状与基因组多位点关联分析软件

成果基本信息
关键词：	复杂性状;基因组多位点;基因集富集分析理论;高通量底成本基因分型方法
成果类别：		技术成熟度：
体现形式（基础理论类）：		体现形式（应用技术类）：	无
成果登记号：	360-18-20730977	资源采集日期：	2019-03-15

研究情况
单位名称：	上海交通大学	技术水平：
评价证书号：		评价单位：
评价日期：		评价证书号：

转化情况
转让范围：		推广形式：	无
已转让企业数（个）：	0

联系方式
联系人（平台）：	玉女士	联系人（平台）电话：	0771-5885053
*成果单位详细联系方式请登录会员；还不是会员，马上注册!

成果简介
种业是国家基础性、战略性产业。建设畜禽良种繁育体系，加快本品种选育和新品种培育，推动主要畜禽品种国产化需要应用最新的技术持续的开展遗传改良。鉴于优良种猪三大内涵性状健康、繁殖、肉质测定困难、遗传力低，通过常规育种技术进行改良难以奏效，需要系统挖掘、分析了影响这些性状的功能基因、标记等。　　本软件系统主要功能是利用畜禽重要经济性状全基因组单核苷酸多态性标记关联分析结果，基于基因集富集分析理论，在基因集的层面上探索畜禽重要性状的分子遗传机制。随着畜禽基因组的完成和芯片和二代测序技术等高通量底成本基因分型方法的出现，以全基因组关联分析为基础的重要经济性状遗传机制探讨和分子标记辅助育种已经在欧美等发达国家开始实施，本软件系统可以在基因集的层面上阐释猪、牛和鸡等常见畜禽的生长速度，产蛋量和产奶量等经济性状的遗传机制。用于标记辅助选择SNP集合的筛选，可以提高畜禽育种精度。　　本软件系统主要技术特点采用了基因集富集分析思想，分析结果准确可靠，可重复性强。本软件系统结构简明、功能实用；支持大文件输入和多种数据格式的输入；可运行于多种操作系统，可移植性强。　　该软件系统的应用将能在基因集的层面上揭示常见畜禽重要经济性状的分子遗传机制，进一步将现代的标记辅助选择（MAS）、基因组选择（GS）技术与常规的育种技术相结合，优化生产性能测定体系、遗传评估方法以及信息管理体系，为建成面向企业、可提供持续与动态服务的选种、选配系统奠定基础。进而加快相关性状的遗传改良的进程，节约育种成本，增强企业效益。

成果名称：	复杂性状与基因组多位点关联分析软件	关键词：	复杂性状;基因组多位点;基因集富集分析理论;高通量底成本基因分型方法
成果类别：		一级分类名称：	农业生物技术
二级分类名称：	畜、禽、蚕、蜂	三级分类名称：
研究起止时间：	2008.03 至2010.01	成果体现形式（应用技术类）：	无
成果属性：		成果体现形式（基础理论类）：
技术成熟度：		技术水平：
研究形式：		学科分类1：
单位名称：	上海交通大学	学科分类2：
中图分类号1：		所属高新技术类别：
中图分类号2：	S818.9	课题来源：
应用行业：		课题立项名称：
国家科技计划子类别：		课题立项编号：
经费实际投入额（万元）：	200.00	评价单位：
评价形式：	无	应用状态：	无
评价日期：		转让范围：
评价证书号：		推荐单位：
推广形式：	无	成果登记号：	360-18-20730977
成果简介：	种业是国家基础性、战略性产业。建设畜禽良种繁育体系，加快本品种选育和新品种培育，推动主要畜禽品种国产化需要应用最新的技术持续的开展遗传改良。鉴于优良种猪三大内涵性状健康、繁殖、肉质测定困难、遗传力低，通过常规育种技术进行改良难以奏效，需要系统挖掘、分析了影响这些性状的功能基因、标记等。　　本软件系统主要功能是利用畜禽重要经济性状全基因组单核苷酸多态性标记关联分析结果，基于基因集富集分析理论，在基因集的层面上探索畜禽重要性状的分子遗传机制。随着畜禽基因组的完成和芯片和二代测序技术等高通量底成本基因分型方法的出现，以全基因组关联分析为基础的重要经济性状遗传机制探讨和分子标记辅助育种已经在欧美等发达国家开始实施，本软件系统可以在基因集的层面上阐释猪、牛和鸡等常见畜禽的生长速度，产蛋量和产奶量等经济性状的遗传机制。用于标记辅助选择SNP集合的筛选，可以提高畜禽育种精度。　　本软件系统主要技术特点采用了基因集富集分析思想，分析结果准确可靠，可重复性强。本软件系统结构简明、功能实用；支持大文件输入和多种数据格式的输入；可运行于多种操作系统，可移植性强。　　该软件系统的应用将能在基因集的层面上揭示常见畜禽重要经济性状的分子遗传机制，进一步将现代的标记辅助选择（MAS）、基因组选择（GS）技术与常规的育种技术相结合，优化生产性能测定体系、遗传评估方法以及信息管理体系，为建成面向企业、可提供持续与动态服务的选种、选配系统奠定基础。进而加快相关性状的遗传改良的进程，节约育种成本，增强企业效益。
联系人：	张向喆	成果登记日期：	2018-06-08
联系人email：		单位代码：	93100111
邮政编码222：	200240	联系人电话：	021-34207276
单位传真：	021-34204869	单位通讯地址：	上海市东川路800号
单位所在省市：		单位电话：	021-54740000;34207174
转让收入（万元）：	0	单位属性：
合作完成单位：		已转让企业数（个）：	0
成果发布年份：	2018	知识产权形式：
成果完成人：	潘玉春	资源采集日期：	2019-03-15

复杂性状与基因组多位点关联分析软件

最新科技新闻资讯

热门资讯排行

最新科技图文资讯

友情链接