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石家庄HIV-1基因序列分析

成果基本信息
关键词: 医学微生物学;HIV-1;基因序列
成果类别: 应用技术 技术成熟度: 成熟应用阶段
体现形式(基础理论类): / 体现形式(应用技术类): 农业、生物新品种
成果登记号: 20092666 资源采集日期: 10-10-15
研究情况
单位名称: 石家庄市疾病预防控制中心 技术水平: 国内领先
评价证书号: 石市科鉴字[2009]第163号 评价单位: 石家庄市科学技术局
评价日期: / 评价证书号: 石市科鉴字[2009]第163号
转化情况
转让范围: 允许出口 推广形式: 其他
已转让企业数(个): 0
联系方式
联系人(平台): 孵化基地 联系人(平台)电话: 0771-3394012
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成果简介

  1、任务来源:   本课题为石家庄市科技局确定的2005年石家庄市科学技术研究与发展指导计划项目(第一批),项目编号为:05120443。   2、应用领域:   公共卫生领域。   获得性免疫缺陷综合征(AIDS,简称艾滋病)是由人免疫缺陷病毒(HIV)感染而引起,导致被感染者免疫功能的部分或完全丧失,继而发生机会性感染、肿瘤等,临床表现多种多样的一种传染病,通过性接触、血液途径和母婴传播,已成为全球性的重大公共卫生问题和社会问题。由于HIV病毒在复制过程中缺乏自我校正功能,使其基因组具有高度的变异性,在传播过程中产生许多亚型,形成一定的地区和人群分布特点。通过对HIV基因序列测定,对系统进化树分析,可对病毒株进行分型,追踪传染源,研究毒株的变异规律,为HIV的分子流行病、诊断、临床和药物治疗及其疫苗研制等提供基础资料。   3、技术原理:   用含0.15﹪EDTA的真空采血管采集HIV-1感染者和病人静脉血5ml,使用德国Qiagen公司DNA Blood Mini Kit提取试剂盒,自全血中提取HIV-1前病毒DNA,用巢式聚合酶链反应(nest-PCR)对env外膜蛋白基因C2-V3区及邻近基因区668个碱基对(bp)进行扩增,PCR产物经1﹪琼脂糖凝胶电泳观察,选取目的片段扩增阳性的PCR产物送往上海生工生物工程技术服务有限公司纯化并测序,用美国Los Alamos国家实验室HIV核酸序列库中提供的基因分型工具BLAST程序结合系统树分析,对得到的序列进行分析,确定HIV-1亚型分布。   4、性能指标:   共对184名经免疫印迹试验(WB)确认的HIV-1阳性者进行研究,得到148份毒株的测序结果。分属B(欧美B)、B|(泰国B)、C三种亚型和CRF07-BC、CRF01-AE、CRF02-AG、CRF03-AB、CRF11-CPX五种重组亚型。其中B亚型45例占30.41﹪,CRF07-BC37例占25﹪,B|亚型35例占23.65﹪,CRF01-AE25例占16.89﹪,C亚型、CRF02-AG各2例分别占1.35﹪,CRF03-AB、CRF11-CPX各1例分别占0.68﹪。B亚型均为性途径传播,其中同性传播占71.11﹪(32/45),异性传播占28.89﹪(13/45);CRF07-BC亚型以注射毒品传播为主占72.97﹪(27/37),其次是异性传播占18.92﹪(7/37),同性传播占8.11﹪(3/37);B|亚型中供受血者占54.29﹪(19/35),3例母婴传播(8.57﹪)均发生在父母有供受血的家庭,供受血者配偶6例占17.14﹪,其他异性传播占20﹪(7/35);CRF01-AE以同性传播为主占64﹪(16/25),异性传播占32﹪(8/25),还有1例因注射吸毒感染(4﹪);C亚型的2例感染者中1例为从非洲回国的劳务输出人员,1例为非洲籍的入境人员;CRF02-AG、CRF03-AB和CRF11-CPX亚型的感染者均为来自非洲的外籍人员。目前的主要流行株B、B|、CRF01-AE和CRF07-BC的组内基因离散率分别为12.3﹪、10.6﹪、10.2﹪和8.7﹪,流行时间大约在12~9年之间。   5、与国内外同类技术比较:   我国于1996~1998年,在全国范围内进行了第一次大规模分子流行病学研究,从除西藏外的30个省、自治区、直辖市共发现了A、B、B|、C、D、E、F、G八种毒株,其中B|亚型占47.5﹪,C亚型占34.3﹪,E亚型占9.6﹪,其余4种占5.7﹪至0.3﹪。2001~2003年我国进行了第二次全国HIV分子流行病学调查,共发现A、B|、B、C、CRF-BC(CRF07-BC、CRF08-BC)、CRF01-AE和CRF02-AG 8种类型的HIV-1亚型。在这8种HIV-1毒株中,CRF-BC亚型占50.20﹪、B|亚型占29.11﹪、CRF01-AE亚型占15.54﹪、B亚型占2.55﹪、A亚型占1.47﹪、C亚型占1.03﹪、CRF02-AG亚型占0.10﹪。第二次流调我国HIV的亚型主要以CRF-BC、B|和CRF01-AE为主(占所有亚型的94.85﹪),与1996~1998年全国HIV分子流调相比,B|亚型已由原来的第一位降至第二位,而CRF-BC亚型则上升为第一位,同时CRF01-AE亚型所占比例也有所增加。   本课题研究显示,石家庄市HIV-1主要亚型为B、CRF-BC、B|和CRF01-AE亚型,与2001~2003年第二次全国HIV分子流行病学调查发现的我国主要以CRF-BC、B|和CRF01-AE亚型为主相比,HIV-1亚型分布格局发生较大变化,通过性传播、特别是在男男性行为人群中蔓延较快的B亚型成为主要的流行亚型,提示随着我国HIV流行趋势转为以性传播为主,特别是通过男男性行为人群感染人数上升迅速的情况下,应加强对B亚型的监测及其传播力、致病性等方面的研究。  6、创新性、先进性:   ①本课题通过对来工作的外籍人员HIV-1感染者基因序列测定发现了国内少见的HIV-1 CRF03-AB和CRF11-CPX亚型;   ②通过对石家庄市HIV/AIDS亚型分布调查分析,发现最早从劳务回国人员中发现的HIV-1 C亚型并未在人群中传播蔓延;   ③通过既往采供血感染及其造成的HIV-1传播全部是B|亚型,人群分离现象明显,提示随着非法采供血事件的淡去,该亚型所占的比例会逐渐降低;   ④本课题研究发现,石家庄市HIV-1流行的主要亚型为B、CRF-BC、B|和CRF01-AE亚型,比较2001~2003年第二次全国HIV分子流行病学调查我国主要流行在吸毒人员中传播的CRF-BC和在采供血人群中传播的B|的结果,HIV-1亚型分布格局发生了较大变化,通过性传播、特别是在男男性行为人群中蔓延较快的B亚型成为主要的流行亚型,提示随着我国HIV流行趋势转为以性传播为主,特别是通过男男性行为人群感染人数上升迅速的情况下,应开展第三次全国性的分子流行病学调查,了解目前我国流行的主要HIV-1亚型,并针对主要毒株进行感染力、免疫原性和传播能力的研究。   7、作用意义通过本课题研究,了解了石家庄市HIV-1流行毒株的亚型分布,追踪到传染来源和传入时间,为制定相应的防控策略提供了技术资料。   推广范围本课题研究成果适宜在全国推广。   推广前景通过对HIV/AIDS进行基因序列测定,可以及时了解特定地区或特定人群的HIV亚型分布,追溯传染来源,对流行病学、临床诊断、药物治疗和疫苗研究等提供基础资料。   推广措施:   ①及时对新发现的HIV/AIDS进行分子流行病学调查,掌握HIV传播的主要流行株和流行变化趋势,特别是随着我国HIV流行趋势转为以性传播为主,应加强对HIV-1 B亚型和CRF01-AE的监测及其病原学、传播力、致病性等基础性研究;   ②开展HIV/AIDS溯源调查,分析HIV-1传播力与毒株分型及其他因素之间的关系和规律;  ③通过对发现的HIV/AIDS追踪随访和基因序列测定,了解不同亚型毒株在个体内的变异速度等情况,探索不同亚型与致病能力、机会性感染和病程进展之间的关系;   ④加强对HIV/AIDS的宣传教育、随访管理,规范开展抗病毒治疗,防治疾病的蔓延传播;  ⑤大力开展预防控制艾滋病的宣传教育,通过主流媒体和深入社区的宣传和活动,提高广大市民的艾滋病防治知识知晓率,增强防病意识和防病能力;   ⑥加大艾滋病高危行为干预工作的力度和广度,深入到高危场所,对艾滋病的高危人群如暗娼、男男性行为者、注射吸毒人员等进行持续的、不间断的面对面宣传和行为干预,提高他们抵御疾病的自觉性和主动参与意识,在高危场所全面推广使用安全套。

成果名称: 石家庄HIV-1基因序列分析 关键词: 医学微生物学;HIV-1;基因序列
成果类别: 应用技术 一级分类名称: 医学生物工程
二级分类名称: / 三级分类名称: /
研究起止时间: 2005.07 至2009.06 成果体现形式(应用技术类): 农业、生物新品种
成果属性: 原始性创新 成果体现形式(基础理论类): /
技术成熟度: 成熟应用阶段 技术水平: 国内领先
研究形式: 独立研究 学科分类1: 180.64
单位名称: 石家庄市疾病预防控制中心 学科分类2: /
中图分类号1: R373.9 所属高新技术类别: 生物、医药和医疗器械
中图分类号2: / 课题来源: 其他
应用行业: 卫生、社会保障和社会福利业 课题立项名称:
国家科技计划子类别: / 课题立项编号: 05120443
经费实际投入额 (万元): 5 评价单位: 石家庄市科学技术局
评价形式: 鉴定 应用状态: 稳定应用
评价日期: / 转让范围: 允许出口
评价证书号: 石市科鉴字[2009]第163号 推荐单位: /
推广形式: 其他 成果登记号: 20092666
成果简介:

  1、任务来源:   本课题为石家庄市科技局确定的2005年石家庄市科学技术研究与发展指导计划项目(第一批),项目编号为:05120443。   2、应用领域:   公共卫生领域。   获得性免疫缺陷综合征(AIDS,简称艾滋病)是由人免疫缺陷病毒(HIV)感染而引起,导致被感染者免疫功能的部分或完全丧失,继而发生机会性感染、肿瘤等,临床表现多种多样的一种传染病,通过性接触、血液途径和母婴传播,已成为全球性的重大公共卫生问题和社会问题。由于HIV病毒在复制过程中缺乏自我校正功能,使其基因组具有高度的变异性,在传播过程中产生许多亚型,形成一定的地区和人群分布特点。通过对HIV基因序列测定,对系统进化树分析,可对病毒株进行分型,追踪传染源,研究毒株的变异规律,为HIV的分子流行病、诊断、临床和药物治疗及其疫苗研制等提供基础资料。   3、技术原理:   用含0.15﹪EDTA的真空采血管采集HIV-1感染者和病人静脉血5ml,使用德国Qiagen公司DNA Blood Mini Kit提取试剂盒,自全血中提取HIV-1前病毒DNA,用巢式聚合酶链反应(nest-PCR)对env外膜蛋白基因C2-V3区及邻近基因区668个碱基对(bp)进行扩增,PCR产物经1﹪琼脂糖凝胶电泳观察,选取目的片段扩增阳性的PCR产物送往上海生工生物工程技术服务有限公司纯化并测序,用美国Los Alamos国家实验室HIV核酸序列库中提供的基因分型工具BLAST程序结合系统树分析,对得到的序列进行分析,确定HIV-1亚型分布。   4、性能指标:   共对184名经免疫印迹试验(WB)确认的HIV-1阳性者进行研究,得到148份毒株的测序结果。分属B(欧美B)、B|(泰国B)、C三种亚型和CRF07-BC、CRF01-AE、CRF02-AG、CRF03-AB、CRF11-CPX五种重组亚型。其中B亚型45例占30.41﹪,CRF07-BC37例占25﹪,B|亚型35例占23.65﹪,CRF01-AE25例占16.89﹪,C亚型、CRF02-AG各2例分别占1.35﹪,CRF03-AB、CRF11-CPX各1例分别占0.68﹪。B亚型均为性途径传播,其中同性传播占71.11﹪(32/45),异性传播占28.89﹪(13/45);CRF07-BC亚型以注射毒品传播为主占72.97﹪(27/37),其次是异性传播占18.92﹪(7/37),同性传播占8.11﹪(3/37);B|亚型中供受血者占54.29﹪(19/35),3例母婴传播(8.57﹪)均发生在父母有供受血的家庭,供受血者配偶6例占17.14﹪,其他异性传播占20﹪(7/35);CRF01-AE以同性传播为主占64﹪(16/25),异性传播占32﹪(8/25),还有1例因注射吸毒感染(4﹪);C亚型的2例感染者中1例为从非洲回国的劳务输出人员,1例为非洲籍的入境人员;CRF02-AG、CRF03-AB和CRF11-CPX亚型的感染者均为来自非洲的外籍人员。目前的主要流行株B、B|、CRF01-AE和CRF07-BC的组内基因离散率分别为12.3﹪、10.6﹪、10.2﹪和8.7﹪,流行时间大约在12~9年之间。   5、与国内外同类技术比较:   我国于1996~1998年,在全国范围内进行了第一次大规模分子流行病学研究,从除西藏外的30个省、自治区、直辖市共发现了A、B、B|、C、D、E、F、G八种毒株,其中B|亚型占47.5﹪,C亚型占34.3﹪,E亚型占9.6﹪,其余4种占5.7﹪至0.3﹪。2001~2003年我国进行了第二次全国HIV分子流行病学调查,共发现A、B|、B、C、CRF-BC(CRF07-BC、CRF08-BC)、CRF01-AE和CRF02-AG 8种类型的HIV-1亚型。在这8种HIV-1毒株中,CRF-BC亚型占50.20﹪、B|亚型占29.11﹪、CRF01-AE亚型占15.54﹪、B亚型占2.55﹪、A亚型占1.47﹪、C亚型占1.03﹪、CRF02-AG亚型占0.10﹪。第二次流调我国HIV的亚型主要以CRF-BC、B|和CRF01-AE为主(占所有亚型的94.85﹪),与1996~1998年全国HIV分子流调相比,B|亚型已由原来的第一位降至第二位,而CRF-BC亚型则上升为第一位,同时CRF01-AE亚型所占比例也有所增加。   本课题研究显示,石家庄市HIV-1主要亚型为B、CRF-BC、B|和CRF01-AE亚型,与2001~2003年第二次全国HIV分子流行病学调查发现的我国主要以CRF-BC、B|和CRF01-AE亚型为主相比,HIV-1亚型分布格局发生较大变化,通过性传播、特别是在男男性行为人群中蔓延较快的B亚型成为主要的流行亚型,提示随着我国HIV流行趋势转为以性传播为主,特别是通过男男性行为人群感染人数上升迅速的情况下,应加强对B亚型的监测及其传播力、致病性等方面的研究。  6、创新性、先进性:   ①本课题通过对来工作的外籍人员HIV-1感染者基因序列测定发现了国内少见的HIV-1 CRF03-AB和CRF11-CPX亚型;   ②通过对石家庄市HIV/AIDS亚型分布调查分析,发现最早从劳务回国人员中发现的HIV-1 C亚型并未在人群中传播蔓延;   ③通过既往采供血感染及其造成的HIV-1传播全部是B|亚型,人群分离现象明显,提示随着非法采供血事件的淡去,该亚型所占的比例会逐渐降低;   ④本课题研究发现,石家庄市HIV-1流行的主要亚型为B、CRF-BC、B|和CRF01-AE亚型,比较2001~2003年第二次全国HIV分子流行病学调查我国主要流行在吸毒人员中传播的CRF-BC和在采供血人群中传播的B|的结果,HIV-1亚型分布格局发生了较大变化,通过性传播、特别是在男男性行为人群中蔓延较快的B亚型成为主要的流行亚型,提示随着我国HIV流行趋势转为以性传播为主,特别是通过男男性行为人群感染人数上升迅速的情况下,应开展第三次全国性的分子流行病学调查,了解目前我国流行的主要HIV-1亚型,并针对主要毒株进行感染力、免疫原性和传播能力的研究。   7、作用意义通过本课题研究,了解了石家庄市HIV-1流行毒株的亚型分布,追踪到传染来源和传入时间,为制定相应的防控策略提供了技术资料。   推广范围本课题研究成果适宜在全国推广。   推广前景通过对HIV/AIDS进行基因序列测定,可以及时了解特定地区或特定人群的HIV亚型分布,追溯传染来源,对流行病学、临床诊断、药物治疗和疫苗研究等提供基础资料。   推广措施:   ①及时对新发现的HIV/AIDS进行分子流行病学调查,掌握HIV传播的主要流行株和流行变化趋势,特别是随着我国HIV流行趋势转为以性传播为主,应加强对HIV-1 B亚型和CRF01-AE的监测及其病原学、传播力、致病性等基础性研究;   ②开展HIV/AIDS溯源调查,分析HIV-1传播力与毒株分型及其他因素之间的关系和规律;  ③通过对发现的HIV/AIDS追踪随访和基因序列测定,了解不同亚型毒株在个体内的变异速度等情况,探索不同亚型与致病能力、机会性感染和病程进展之间的关系;   ④加强对HIV/AIDS的宣传教育、随访管理,规范开展抗病毒治疗,防治疾病的蔓延传播;  ⑤大力开展预防控制艾滋病的宣传教育,通过主流媒体和深入社区的宣传和活动,提高广大市民的艾滋病防治知识知晓率,增强防病意识和防病能力;   ⑥加大艾滋病高危行为干预工作的力度和广度,深入到高危场所,对艾滋病的高危人群如暗娼、男男性行为者、注射吸毒人员等进行持续的、不间断的面对面宣传和行为干预,提高他们抵御疾病的自觉性和主动参与意识,在高危场所全面推广使用安全套。

联系人: 刘丽花 成果登记日期: 09-11-17
联系人email: liulihua067@126.com 单位代码: 91300132
邮政编码222: 050011 联系人电话: 13933881172
单位传真: 031186038642 单位通讯地址: 石家庄市栗康街19号
单位所在省市: 河北省 单位电话: 0311-86032070;86964884;86082023
转让收入(万元): 0 单位属性: 其他
合作完成单位: / 已转让企业数(个): 0
成果发布年份: 2010 知识产权形式:
成果完成人: 刘丽花;李秀娟;李卫红;徐保红;周红;马学志;刘淑君;党静;王莹莹;刘晓松;吕国平 资源采集日期: 10-10-15

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