本研究所针对的科学问题是：蛋白质抗原表位结构特性与免疫学效应的关系。既往认识到就某一蛋白质抗原而言，可能存在对于保护性免疫有利和不利的表位；由于许多天然抗原引发的免疫反应不能满足预防发病或治疗的需要，为了提高蛋白质抗原的保护性，就必须在表位水平上做出选择，摒除后者，保留、改善前者以得到更理想的疫苗分子。基于上述研究背景，我们将研究集中在了以下4个全新的问题上： 1.重要蛋白质抗原的表位及其功能的发现与鉴定，进一步研究这些表位与疾病发生发展的关系，发现了新的功能表位并提出了细胞毒性T细胞(CTL)表位可以按功能分类的观点，并提出了“氨基酸密码学说”。 2.针对“表位具有什么结构特点”、“能否根据蛋白质抗原的一级序列就能预测表位的位置和序列”、“决定表位抗原性、MHC限制性、T细胞反应库谱的结构基础是什么”等问题建立了新的表位预测方法，并对天然表位进行改进。 3. 根据已知表位如何构建免疫原提出并建立了“epitope-based vaccine design”的全新技术路线，在表位的组合与搭配、如何提高小肽抗原免疫原性、如何在体启动CTL反应等当前免疫学面临的重要技术难题取得突破。 4. 针对如何根据表位构建治疗性疫苗提出了 “通过mimogen (模拟抗原)而非前人所用天然抗原(antigen)克服免疫耐受”的全新思路，并在乙肝和肿瘤模型证明了其可行性。

本研究所针对的科学问题是：蛋白质抗原表位结构特性与免疫学效应的关系。既往认识到就某一蛋白质抗原而言，可能存在对于保护性免疫有利和不利的表位；由于许多天然抗原引发的免疫反应不能满足预防发病或治疗的需要，为了提高蛋白质抗原的保护性，就必须在表位水平上做出选择，摒除后者，保留、改善前者以得到更理想的疫苗分子。基于上述研究背景，我们将研究集中在了以下4个全新的问题上： 1.重要蛋白质抗原的表位及其功能的发现与鉴定，进一步研究这些表位与疾病发生发展的关系，发现了新的功能表位并提出了细胞毒性T细胞(CTL)表位可以按功能分类的观点，并提出了“氨基酸密码学说”。 2.针对“表位具有什么结构特点”、“能否根据蛋白质抗原的一级序列就能预测表位的位置和序列”、“决定表位抗原性、MHC限制性、T细胞反应库谱的结构基础是什么”等问题建立了新的表位预测方法，并对天然表位进行改进。 3. 根据已知表位如何构建免疫原提出并建立了“epitope-based vaccine design”的全新技术路线，在表位的组合与搭配、如何提高小肽抗原免疫原性、如何在体启动CTL反应等当前免疫学面临的重要技术难题取得突破。 4. 针对如何根据表位构建治疗性疫苗提出了 “通过mimogen (模拟抗原)而非前人所用天然抗原(antigen)克服免疫耐受”的全新思路，并在乙肝和肿瘤模型证明了其可行性。