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细菌16S rRNA基因实时荧光PCR定量、分型方法的建立及临床初步运用

成果基本信息
关键词: 方法;细菌;分型;16S rRNA;建立
成果类别: 应用技术 技术成熟度: 初期阶段
体现形式(基础理论类): / 体现形式(应用技术类): 新工艺
成果登记号: 08062056 资源采集日期: 10-2-10
研究情况
单位名称: 浙江大学医学院附属儿童医院 技术水平: 国际先进
评价证书号: / 评价单位: 浙江省卫生厅
评价日期: / 评价证书号: /
转化情况
转让范围: 限国内转让 推广形式: 合作开发
已转让企业数(个): 0
联系方式
联系人(平台): 孵化基地 联系人(平台)电话: 0771-3394012
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成果简介

  分析临床常见菌16S rRNA基因序列,在高度保守区自行设计通用引物和革兰阳性和阴性分型探针,建立细菌革兰阴、阳性菌双通道荧光定量PCR检测体系,选取临床较常见的53株临床分离株(25株为革兰阳性菌、28株为革兰阴性菌)和对照品进行该方法检测评价,研究发现细菌实时荧光定量、分型PCR方法具有较好的敏感度和特异性,能稳定检测到10CFU细菌数,25株革兰阳性菌株通过革兰阳性探针(FAM通道)检测均为阳性,28株革兰阴性菌株通过革兰阴性探针(VIC通道)检测均为阳性,反之均为阴性,符合率100%。巨细胞病毒、乙肝病毒,新型隐球菌,人基因组DNA及空白对照均为阴性。对1000例血标本和125份脑脊液标本进行细菌实时荧光定量、分型PCR方法和细菌培养对照实验,细菌实时荧光定量分型PCR方法的阳性率高于细菌培养,差异有统计学意义(P<0.01);以细菌培养为对照,该方法检测敏感度为91.07%,特异性为97.36%,检测符合率为97.05%。该方法具有快速、特异、敏感的特点,可为临床早期、准确诊断败血症和化脑等细菌性感染疾病提供新方法。

成果名称: 细菌16S rRNA基因实时荧光PCR定量、分型方法的建立及临床初步运用 关键词: 方法;细菌;分型;16S rRNA;建立
成果类别: 应用技术 一级分类名称: 医学生物工程
二级分类名称: / 三级分类名称: /
研究起止时间: 2006.07 至2008.12 成果体现形式(应用技术类): 新工艺
成果属性: 原始性创新 成果体现形式(基础理论类): /
技术成熟度: 初期阶段 技术水平: 国际先进
研究形式: 独立研究 学科分类1: 320.11
单位名称: 浙江大学医学院附属儿童医院 学科分类2: /
中图分类号1: R446.9 所属高新技术类别: 生物、医药和医疗器械
中图分类号2: / 课题来源: 部门基金
应用行业: 卫生、社会保障和社会福利业 课题立项名称:
国家科技计划子类别: / 课题立项编号: 2006A074
经费实际投入额 (万元): 3 评价单位: 浙江省卫生厅
评价形式: 验收 应用状态: 稳定应用
评价日期: / 转让范围: 限国内转让
评价证书号: / 推荐单位: 浙江大学医学院附属儿童医院
推广形式: 合作开发 成果登记号: 08062056
成果简介:

  分析临床常见菌16S rRNA基因序列,在高度保守区自行设计通用引物和革兰阳性和阴性分型探针,建立细菌革兰阴、阳性菌双通道荧光定量PCR检测体系,选取临床较常见的53株临床分离株(25株为革兰阳性菌、28株为革兰阴性菌)和对照品进行该方法检测评价,研究发现细菌实时荧光定量、分型PCR方法具有较好的敏感度和特异性,能稳定检测到10CFU细菌数,25株革兰阳性菌株通过革兰阳性探针(FAM通道)检测均为阳性,28株革兰阴性菌株通过革兰阴性探针(VIC通道)检测均为阳性,反之均为阴性,符合率100%。巨细胞病毒、乙肝病毒,新型隐球菌,人基因组DNA及空白对照均为阴性。对1000例血标本和125份脑脊液标本进行细菌实时荧光定量、分型PCR方法和细菌培养对照实验,细菌实时荧光定量分型PCR方法的阳性率高于细菌培养,差异有统计学意义(P<0.01);以细菌培养为对照,该方法检测敏感度为91.07%,特异性为97.36%,检测符合率为97.05%。该方法具有快速、特异、敏感的特点,可为临床早期、准确诊断败血症和化脑等细菌性感染疾病提供新方法。

联系人: 吴亦栋 成果登记日期: 09-1-9
联系人email: / 单位代码: 93300029
邮政编码222: 310003 联系人电话: 13777834317
单位传真: 0571-87033296 单位通讯地址: 浙江省杭州市下城区竹竿巷57号
单位所在省市: 江苏省 单位电话: 0571-87078641
转让收入(万元): 0 单位属性: 医疗机构
合作完成单位: / 已转让企业数(个): 0
成果发布年份: 2008 知识产权形式:
成果完成人: / 资源采集日期: 10-2-10

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