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IL1和TNF基因启动子SNP高分辨熔解分子诊断新技术的建立及临床应用评价

成果基本信息
关键词: 高分辨熔解技术;无标记探针;PCR
成果类别: 应用技术 技术成熟度: 初期阶段
体现形式(基础理论类): / 体现形式(应用技术类): 新技术
成果登记号: 2010Y0405 资源采集日期: 11-10-10
研究情况
单位名称: 兰州大学第二医院 技术水平: 国内领先
评价证书号: / 评价单位: 甘肃省科技厅
评价日期: 2010.12.06 评价证书号: /
转化情况
转让范围: 限国内转让 推广形式: 合作开发
已转让企业数(个): 0
联系方式
联系人(平台): 孵化基地 联系人(平台)电话: 0771-3394012
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成果简介

  (1)课题来源与背景:   甘肃省科技厅科技支撑项目,项目编号:090NKCA094。   (2)技术原理及性能指标:   基本原理是利用双链DNA分子热变性时嵌入其中的荧光染料释放发生减色效应形成特征熔解曲线,由于DNA序列的长度,GC含量以及碱基互补性的差异在运行高分辨率熔解后会形成不同的特异熔解曲线,其分辨精度可以达到对单个碱基差异的区分。相比传统的SNP或突变分析法和定量探针法,HRM简化了操作时间和步骤,大大降低了使用成本,并且实现了闭管操作,使其用于临床常规化检测成为可能。性能指标:建立高分辨熔解曲线分析技术平台,拥有适合qPCR仪检测分析的荧光染料和酶系统,形成检测IL-1和TNF以及IL-6基因启动子SNP的PCR-HRM或PCR-UP-HRM临床分子诊断方法和评价其性能指标如特异性、灵敏度和重复性等。   (3)技术的创新性与先进性:   本项目是引进国外新技术进行本土化再创新,通过筛选、优化酶系统和荧光染料研制本土化的PCR-HRM检测反应体系,其检测性能接近国外商品化PCR-HRM检测反应体系(EvaGreen MasterMix)。引进消化吸收国外最新技术,再创新建立本土化高分辨熔解分析技术平台,尤其是对荧光染料和酶系统的最佳组合和搭配研究以及与无标记探针技术的结合。将HRM技术用于临床分子诊断,制定其质量控制措施是对传统昂贵的探针法提出挑战,孕育新一代廉价基因分型分子诊断试剂。   (4)技术的成熟程度、适用范围和安全性:基本成熟,适用基因突变检测和扫描。   (5)应用情况及存在问题:正在推广应用。

成果名称: IL1和TNF基因启动子SNP高分辨熔解分子诊断新技术的建立及临床应用评价 关键词: 高分辨熔解技术;无标记探针;PCR
成果类别: 应用技术 一级分类名称: 医学生物工程
二级分类名称: / 三级分类名称: /
研究起止时间: 2009.01 至2010.10 成果体现形式(应用技术类): 新技术
成果属性: 国外引进消化吸收创新 成果体现形式(基础理论类): /
技术成熟度: 初期阶段 技术水平: 国内领先
研究形式: 独立研究 学科分类1: 320.11
单位名称: 兰州大学第二医院 学科分类2: /
中图分类号1: R446.5 所属高新技术类别: 生物、医药和医疗器械
中图分类号2: / 课题来源: 地方计划
应用行业: 卫生、社会保障和社会福利业 课题立项名称:
国家科技计划子类别: / 课题立项编号: 090NKCA094
经费实际投入额 (万元): 2 评价单位: 甘肃省科技厅
评价形式: 鉴定 应用状态: 稳定应用
评价日期: 2010.12.06 转让范围: 限国内转让
评价证书号: / 推荐单位: 兰州大学
推广形式: 合作开发 成果登记号: 2010Y0405
成果简介:

  (1)课题来源与背景:   甘肃省科技厅科技支撑项目,项目编号:090NKCA094。   (2)技术原理及性能指标:   基本原理是利用双链DNA分子热变性时嵌入其中的荧光染料释放发生减色效应形成特征熔解曲线,由于DNA序列的长度,GC含量以及碱基互补性的差异在运行高分辨率熔解后会形成不同的特异熔解曲线,其分辨精度可以达到对单个碱基差异的区分。相比传统的SNP或突变分析法和定量探针法,HRM简化了操作时间和步骤,大大降低了使用成本,并且实现了闭管操作,使其用于临床常规化检测成为可能。性能指标:建立高分辨熔解曲线分析技术平台,拥有适合qPCR仪检测分析的荧光染料和酶系统,形成检测IL-1和TNF以及IL-6基因启动子SNP的PCR-HRM或PCR-UP-HRM临床分子诊断方法和评价其性能指标如特异性、灵敏度和重复性等。   (3)技术的创新性与先进性:   本项目是引进国外新技术进行本土化再创新,通过筛选、优化酶系统和荧光染料研制本土化的PCR-HRM检测反应体系,其检测性能接近国外商品化PCR-HRM检测反应体系(EvaGreen MasterMix)。引进消化吸收国外最新技术,再创新建立本土化高分辨熔解分析技术平台,尤其是对荧光染料和酶系统的最佳组合和搭配研究以及与无标记探针技术的结合。将HRM技术用于临床分子诊断,制定其质量控制措施是对传统昂贵的探针法提出挑战,孕育新一代廉价基因分型分子诊断试剂。   (4)技术的成熟程度、适用范围和安全性:基本成熟,适用基因突变检测和扫描。   (5)应用情况及存在问题:正在推广应用。

联系人: 科教部科研科 成果登记日期: 10-12-7
联系人email: ldeykyk@yahoo.cn 单位代码: 96200039
邮政编码222: 730000 联系人电话: 0931-8942722
单位传真: 0931-8942722 单位通讯地址: 兰州市萃英门82号
单位所在省市: 甘肃省 单位电话: 0931-8942240;8942722
转让收入(万元): 0 单位属性: 大专院校
合作完成单位: / 已转让企业数(个): 0
成果发布年份: 2011 知识产权形式:
成果完成人: 尤崇革;呼志斌;王丽萍;郜莉娜;施鑫鹤;王芳芳;李菲菲 资源采集日期: 11-10-10

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