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PCR-SSP法分析人群MBL单体基因型

成果基本信息
关键词: 甘露糖结合凝集素;基因多态性;单体基因型
成果类别: 基础理论 技术成熟度: /
体现形式(基础理论类): 论文 体现形式(应用技术类): /
成果登记号: 10001295 资源采集日期: 11-10-10
研究情况
单位名称: 杭州市第二人民医院 技术水平: 国内领先
评价证书号: / 评价单位: 杭州市科技局
评价日期: 2010.02.02 评价证书号: /
转化情况
转让范围: / 推广形式: /
已转让企业数(个): 0
联系方式
联系人(平台): 孵化基地 联系人(平台)电话: 0771-3394012
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成果简介

  本研究同时应用基于PCR-SSP的时间飞行质谱技术和序列分析法分析了人群MBL基因启动子区和外显子区所有20个单核苷酸多态性(SNP)位点的多态性,重点分析外显子1区+223、+230、+239位点和启动子区-550、-221位点以及5|端非翻译区+4位点这6个关键位点的单核苷酸变异频率,同时对外显子2进行了研究和血浆MBL浓度检测,结果发现:汉族、蒙古组和回族人群中仅蒙古族人群发现1例外显子1为D型,无C型变异发现。+230位点即B型变异变异频率为0.205~0.275,-550位点的变异最高,为0.433~0.514,-221位点的变异频率为0.120~0.138;传统位点间的单体基因型主要有HYPA、LYPB、LYPA、LXPA、LYQA这5种,频率最高的是HYPA;在外显子2的+101密码子和+85密码子发现两处单碱基突变,已在基因库中登记并公布,基因号分别为EU726526和EU481972。研究中发现,研究总体中有部分样本无法经序列分析正向测序,经时间飞行质谱技术分析发现,这少部分样本正是同时存在+4位点、-427位点、-349位点变异的个体,这3个位点间存呈完全连锁不平衡遗传。 本研究应用时间飞行质谱技术进行人群MBL基因多态性研究,为今后研究同类基因多态性提供了方法学的支撑。

成果名称: PCR-SSP法分析人群MBL单体基因型 关键词: 甘露糖结合凝集素;基因多态性;单体基因型
成果类别: 基础理论 一级分类名称: 医学生物工程
二级分类名称: / 三级分类名称: /
研究起止时间: 2006.01 至2009.12 成果体现形式(应用技术类): /
成果属性: / 成果体现形式(基础理论类): 论文
技术成熟度: / 技术水平: 国内领先
研究形式: 与院校、所合作 学科分类1: 310.27
单位名称: 杭州市第二人民医院 学科分类2: /
中图分类号1: R394.5 所属高新技术类别: /
中图分类号2: / 课题来源: 地方计划
应用行业: 卫生、社会保障和社会福利业 课题立项名称:
国家科技计划子类别: / 课题立项编号: 2005633Q08
经费实际投入额 (万元): 12 评价单位: 杭州市科技局
评价形式: 验收 应用状态: /
评价日期: 2010.02.02 转让范围: /
评价证书号: / 推荐单位: /
推广形式: / 成果登记号: 10001295
成果简介:

  本研究同时应用基于PCR-SSP的时间飞行质谱技术和序列分析法分析了人群MBL基因启动子区和外显子区所有20个单核苷酸多态性(SNP)位点的多态性,重点分析外显子1区+223、+230、+239位点和启动子区-550、-221位点以及5|端非翻译区+4位点这6个关键位点的单核苷酸变异频率,同时对外显子2进行了研究和血浆MBL浓度检测,结果发现:汉族、蒙古组和回族人群中仅蒙古族人群发现1例外显子1为D型,无C型变异发现。+230位点即B型变异变异频率为0.205~0.275,-550位点的变异最高,为0.433~0.514,-221位点的变异频率为0.120~0.138;传统位点间的单体基因型主要有HYPA、LYPB、LYPA、LXPA、LYQA这5种,频率最高的是HYPA;在外显子2的+101密码子和+85密码子发现两处单碱基突变,已在基因库中登记并公布,基因号分别为EU726526和EU481972。研究中发现,研究总体中有部分样本无法经序列分析正向测序,经时间飞行质谱技术分析发现,这少部分样本正是同时存在+4位点、-427位点、-349位点变异的个体,这3个位点间存呈完全连锁不平衡遗传。 本研究应用时间飞行质谱技术进行人群MBL基因多态性研究,为今后研究同类基因多态性提供了方法学的支撑。

联系人: 胡侠翔 成果登记日期: 10-12-24
联系人email: / 单位代码: 93301046
邮政编码222: 310015 联系人电话: 0571-88303511
单位传真: / 单位通讯地址: 杭州市温州路126号
单位所在省市: 江苏省 单位电话: 0571-88017958;88303553
转让收入(万元): 0 单位属性: 医疗机构
合作完成单位: 浙江大学医学院附属儿童医院 已转让企业数(个): 0
成果发布年份: 2011 知识产权形式:
成果完成人: 华春珍;冷贵兰;陈兆军;张腊红;刘霞;尚世强 资源采集日期: 11-10-10

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