该项目属于基础医学和预防医学领域。病毒性传染病（如HIV-1和SARS）严重危害人类的生存和健康，其遗传进化规律及检测方法对了解病毒致病机制及预防和控制其传播和流行有重要作用，对维护人类的健康和国家稳定发展意义重大。 　　1、对SARS-CoV跨种间传播的适应性机制进行了研究，发现病毒S蛋白在跨种间传播过程中经历逐步适应的进化过程。在跨种传播早期正选择主要作用于受体识别的区域；跨种传播中期，正选择主要作用于S蛋白的膜融合区域，在后期则受到很强的负选择压力。由此我们提出了动物源性病毒跨种传播到人类的适应性进化模型（他引18次）； 　　2、研究HIV-1重组的机制和驱动力，首次发现HIV-1基因组特定区域的碱基次序决定的高茎环潜能（FORS-D）在HIV-1亚型间重组的产生过程中扮演着重要角色，说明核酸二级结构影响病毒重组，对研究HIV-1重组产生机制具有重要意义； 　　3、HIV-1细胞嗜性是HIV-1致病机制的关键所在，预测感染者体内HIV-1的表型和受体型将提供感染者疾病状况的重要指标。我们首次利用Random Forest算法，建立了基于V3序列的HIV-1受体型及表型预测的生物信息学软件，其准确率高于国外其它方法，并将其在线化提供在线预测服务； 　　4、首次建立了基于SYBR GreenⅠ的相对实时定量方法，用于进行HIV-1核酸及基因表达的相对定量，该方法不需要制备定量标准品，即经济，又省时省力，已经被广泛引用和应用（他引150次）； 　　5、改进HIV-1中和抗体检测的方法，为HIV-1疫苗效果的判定及抗HIV-1体液免疫反应的检测提供一个可信的检测方法。 　　本项目工作不仅加深了对人类病毒传播机制的了解，对防控未来可能发生的新病毒爆发具有重要参考价值，也为发展人类病毒相关诊断技术提供了必要的方法基础，对预防控制我省乃至全国病毒性传染病具有重大意义，对国民经济发展及社会稳定也有很大促进作用。

　　该项目属于基础医学和预防医学领域。病毒性传染病（如HIV-1和SARS）严重危害人类的生存和健康，其遗传进化规律及检测方法对了解病毒致病机制及预防和控制其传播和流行有重要作用，对维护人类的健康和国家稳定发展意义重大。 　　1、对SARS-CoV跨种间传播的适应性机制进行了研究，发现病毒S蛋白在跨种间传播过程中经历逐步适应的进化过程。在跨种传播早期正选择主要作用于受体识别的区域；跨种传播中期，正选择主要作用于S蛋白的膜融合区域，在后期则受到很强的负选择压力。由此我们提出了动物源性病毒跨种传播到人类的适应性进化模型（他引18次）； 　　2、研究HIV-1重组的机制和驱动力，首次发现HIV-1基因组特定区域的碱基次序决定的高茎环潜能（FORS-D）在HIV-1亚型间重组的产生过程中扮演着重要角色，说明核酸二级结构影响病毒重组，对研究HIV-1重组产生机制具有重要意义； 　　3、HIV-1细胞嗜性是HIV-1致病机制的关键所在，预测感染者体内HIV-1的表型和受体型将提供感染者疾病状况的重要指标。我们首次利用Random Forest算法，建立了基于V3序列的HIV-1受体型及表型预测的生物信息学软件，其准确率高于国外其它方法，并将其在线化提供在线预测服务； 　　4、首次建立了基于SYBR GreenⅠ的相对实时定量方法，用于进行HIV-1核酸及基因表达的相对定量，该方法不需要制备定量标准品，即经济，又省时省力，已经被广泛引用和应用（他引150次）； 　　5、改进HIV-1中和抗体检测的方法，为HIV-1疫苗效果的判定及抗HIV-1体液免疫反应的检测提供一个可信的检测方法。 　　本项目工作不仅加深了对人类病毒传播机制的了解，对防控未来可能发生的新病毒爆发具有重要参考价值，也为发展人类病毒相关诊断技术提供了必要的方法基础，对预防控制我省乃至全国病毒性传染病具有重大意义，对国民经济发展及社会稳定也有很大促进作用。