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结核分枝杆菌基因指纹图谱分析研究

成果基本信息
关键词: 结核分枝杆菌;基因指纹图谱;多态性
成果类别: 应用技术 技术成熟度: 成熟应用阶段
体现形式(基础理论类): / 体现形式(应用技术类): 新技术
成果登记号: 10004005 资源采集日期: 11-2-20
研究情况
单位名称: 海宁市疾病预防控制中心 技术水平: 国内先进
评价证书号: / 评价单位: 海宁市科技局
评价日期: 2009.12.30 评价证书号: /
转化情况
转让范围: 允许出口 推广形式: 合作开发
已转让企业数(个): 0
联系方式
联系人(平台): 孵化基地 联系人(平台)电话: 0771-3394012
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成果简介

  本项目研究主要是为了了解海宁市目前结核分枝杆菌的主要流行株,给结核病防治工作提供分子流行病学依据。采用数目可变串联重复序列(VNTR)分型方法对海宁市2008年结核病病人痰标本中分离的95株结核分枝杆菌进行分子分型研究:对95株结核分枝杆菌分离株,提取DNA,采用PCR和琼脂糖凝胶电泳技术对结核分枝杆菌15个VNTR位点进行检测,并通过BioNumerics 5.0软件进行DNA指纹图谱多态性分析。   研究结果表明95株结核分支杆菌的15个VNTR位点显示明显的多态性,经基因聚类分析,共分为10个基因群,共90个基因型。其中Ⅰ群占2.1﹪,Ⅱ群占1.1﹪,Ⅲ群占1.1﹪,Ⅳ群占5.3﹪,Ⅴ群占1.1﹪,Ⅵ群占1.1﹪,Ⅶ群占69.5﹪,Ⅷ群占1.1﹪,Ⅸ群占14.7﹪,Ⅹ群占3.2﹪。   初步证实了海宁市2008年的95株结核分枝杆菌VNTRS存在明显的多态性,至少存在10个VNTR群,其中以Ⅶ群为主要优势流行菌群,所有的基因型与标准菌株H37Rv均不同。   这95株菌株菌群差异比较明显,同一菌群不同菌型的差异也非常明显。与其他地区结核分枝杆菌分子分型相比较,我市这95株结核分枝杆菌显示出更加明显的多态性。这可能与我市地处杭嘉湖平原,外来务工人员较多,人口流动很大有关。本研究显示,我市结核分枝杆菌主要流行群别是Ⅶ群,因此加大该群结核分枝杆菌的研究,对我市结核病防治工作具有重要意义,同时也不能忽视对个体菌株的研究,特别是复发病人复发前后菌株的对照研究。   本项研究为我市结核病防治工作提供分子流行病学依据,具有实用价值和现实指导意义及显著的社会、经济效益。研究成果达到国内同类研究先进水平。

成果名称: 结核分枝杆菌基因指纹图谱分析研究 关键词: 结核分枝杆菌;基因指纹图谱;多态性
成果类别: 应用技术 一级分类名称: 医学生物工程
二级分类名称: / 三级分类名称: /
研究起止时间: 2009.01 至2009.12 成果体现形式(应用技术类): 新技术
成果属性: 原始性创新 成果体现形式(基础理论类): /
技术成熟度: 成熟应用阶段 技术水平: 国内先进
研究形式: 独立研究 学科分类1: 310.41
单位名称: 海宁市疾病预防控制中心 学科分类2: /
中图分类号1: R378.911 所属高新技术类别: 生物、医药和医疗器械
中图分类号2: / 课题来源: 地方计划
应用行业: 卫生、社会保障和社会福利业 课题立项名称:
国家科技计划子类别: / 课题立项编号: 2008AY2089
经费实际投入额 (万元): 10 评价单位: 海宁市科技局
评价形式: 验收 应用状态: 稳定应用
评价日期: 2009.12.30 转让范围: 允许出口
评价证书号: / 推荐单位: 海宁市科技局
推广形式: 合作开发 成果登记号: 10004005
成果简介:

  本项目研究主要是为了了解海宁市目前结核分枝杆菌的主要流行株,给结核病防治工作提供分子流行病学依据。采用数目可变串联重复序列(VNTR)分型方法对海宁市2008年结核病病人痰标本中分离的95株结核分枝杆菌进行分子分型研究:对95株结核分枝杆菌分离株,提取DNA,采用PCR和琼脂糖凝胶电泳技术对结核分枝杆菌15个VNTR位点进行检测,并通过BioNumerics 5.0软件进行DNA指纹图谱多态性分析。   研究结果表明95株结核分支杆菌的15个VNTR位点显示明显的多态性,经基因聚类分析,共分为10个基因群,共90个基因型。其中Ⅰ群占2.1﹪,Ⅱ群占1.1﹪,Ⅲ群占1.1﹪,Ⅳ群占5.3﹪,Ⅴ群占1.1﹪,Ⅵ群占1.1﹪,Ⅶ群占69.5﹪,Ⅷ群占1.1﹪,Ⅸ群占14.7﹪,Ⅹ群占3.2﹪。   初步证实了海宁市2008年的95株结核分枝杆菌VNTRS存在明显的多态性,至少存在10个VNTR群,其中以Ⅶ群为主要优势流行菌群,所有的基因型与标准菌株H37Rv均不同。   这95株菌株菌群差异比较明显,同一菌群不同菌型的差异也非常明显。与其他地区结核分枝杆菌分子分型相比较,我市这95株结核分枝杆菌显示出更加明显的多态性。这可能与我市地处杭嘉湖平原,外来务工人员较多,人口流动很大有关。本研究显示,我市结核分枝杆菌主要流行群别是Ⅶ群,因此加大该群结核分枝杆菌的研究,对我市结核病防治工作具有重要意义,同时也不能忽视对个体菌株的研究,特别是复发病人复发前后菌株的对照研究。   本项研究为我市结核病防治工作提供分子流行病学依据,具有实用价值和现实指导意义及显著的社会、经济效益。研究成果达到国内同类研究先进水平。

联系人: 吴方 成果登记日期: 10-2-13
联系人email: hncdcwf@163.com 单位代码: 93305799
邮政编码222: 314400 联系人电话: 0573-87017251
单位传真: 0573-87017252 单位通讯地址: 海宁市钱江西路(新人民法院旁)
单位所在省市: 江苏省 单位电话: 0573-87017247;87017251
转让收入(万元): 0 单位属性: 医疗机构
合作完成单位: / 已转让企业数(个): 0
成果发布年份: 2010 知识产权形式:
成果完成人: 吴方;朱海燕;钱雪琪;孙品晶;俞丽娜;顾建忠 资源采集日期: 11-2-20

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