本研究的项目来源如下：
1、内蒙古传统发酵乳中乳杆菌耐酸性特异蛋白的分离鉴定(2006～2008),国家自然科学基金项目，项目编号：30560097。
2、高活性益生乳酸菌发酵剂制造核心技术研究(2006～2009)，国家高技术研究发展计划（863计划），项目编号：N0.2006AA10Z345（部分内容）。
3、乳酸菌益生特性研究及益生菌发酵乳开发(2005～2007)，教育部科学技术研究重点项目，项目编号：205028。
益生菌L.casei Zhang系分离、筛选自传统发酵酸马奶中1株性能优异的益生菌。项目研究人员从2002年开始，对L.casei Zhang的益生特性进行了系统的研究。在此基础上，对L.casei Zhang基因组学和蛋白质组学进行了研究。
在基因组学方面采用全基因组鸟枪法测定了L.casei Zhang全基因组序列，并进行了注释及比较分析。结果表明L.casei Zhang的基因组由1条染色体和1个质粒组成，均为环状分子。其中，染色体的长度为2,861,849bp，平均G+C含量为46.1%，共编码2804个开放阅读框；质粒的长度为36,487bp，平均G+C含量为40.1%，共编码44个开放阅读框。乳酸菌比较基因组学分析显示，L.casei Zhang基因组与Lactobacillus plantarum WCSF1基因组有相对较高的相似性。另外，L.casei Zhang染色体中的噬菌体样序列与来自L.plantarum WCSF1基因组中Lp3噬菌体序列有大片段且具有良好线性关系的同源序列。
在蛋白组学方面是以双向电泳技术为基础，建立了益生Lactobacillus casei Zhang的蛋白表达图谱，并进行了分析研究。课题系统优化了干酪乳杆菌蛋白质组二维凝胶电泳技术，在此基础上，建立了L.casei Zhang不同生长时期蛋白质表达图谱，获得了酸和胆盐胁迫下差异表达蛋白质图谱，并应用质谱检测和生物信息学进行了比较分析。
L.casei Zhang基因组学和蛋白质组学的研究是我国第一个完成的益生乳酸菌基因组和蛋白质组方面的研究，不仅为该菌株益生机理的进一步深入研究奠定了基础，而且为该菌株的产业化提供了更加有力的保证。
L.casei Zhang基因组学和蛋白质组学的研究从分子生物学角度分析了益生乳酸菌生物学功能及机制，进而为进一步改造和选育优良益生菌奠定了基础，对提高我国益生乳酸菌的研究水平将会起到积极的推进作用。
该项目的开启了我国乳酸菌基因组学和蛋白质组学研究的先河，标志着我国乳酸菌的研究开始进入基因组和蛋白质组时代，同时也将成为我国乳酸菌研究史上的一个里程碑。 |
