合成生物学,是在系统生物学的基础上,引入工程学的模块化、标准化概念和系统设计理论,设计创建元件、模块、体系,实现合成生物体系在化学品制造(包括材料、能源、或天然产物分子)、医学、农业、环境等领域的规模化应用。
本项目提出开发灵活、模块化、小型化的实验室设备自动进行样品前处理, 为现有的合成生物学研究项目提供支撑,具体包括哈佛大学最近发表的多路自动化基因组工程(Multiplex Automated Genome Engineering, MAGE)以及噬菌体辅助连续进化(Phage-Assisted Continuous Evolution, PACE)。
通过开发一种模块化仪器,可以应用于酶连续进化,自动完成耗费时间和劳动密集的实验步骤,从而帮助实验人员获取样品完成后续实验。为了实现高度灵活性,并避免创建过多的产品复杂性,开发的模块化仪器有4个层次:(1)设备机柜,(2)隔间或抽屉,(3)模块,(4)模块内的常用组件。利用开发的仪器,与项目合作方广州浪奇日用品有限公司进行相关酶产品的改进,为新兴的洗涤剂添加用酶开发提供支持。
经过两年多的项目实施,项目组完成了仪器原型机的开发,经广东省质量监督机械检验站检测,原型机所检指标达到任务书要求;以原型机相关模块为基础,对广州浪奇日用品有限公司的相关酶产品进行了测试改进,完成了2种新产品和2种新工艺的开发工作。
项目开发的原型机是一套复杂的自动化系统,系统的各项运行参数还需要根据后续更多的实验测试持续优化,而且由于系统需要用来进行生物实验,系统的污染问题始终是一个需要特别注意的方面,目前我们采用清洗剂+紫外照射的清洗方式,清洗结果有时依然不理想,后续还需要持续改进。
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