成果基本信息 | ||||||
关键词: | 合浦珠母贝;转录组;表型性状;cDNA-SNP分型 | |||||
成果类别: | 技术成熟度: | |||||
体现形式(基础理论类): | 体现形式(应用技术类): | 无 | ||||
成果登记号: | 4602018J0073 | 资源采集日期: | 2019-03-15 |
研究情况 | |||||
单位名称: | 中国水产科学研究院南海水产研究所热带水产研究开发中心 | 技术水平: | |||
评价证书号: | 琼科函[2017]456号 | 评价单位: | 海南省科学技术厅 | ||
评价日期: | 2017.06.13 | 评价证书号: | 琼科函[2017]456号 |
转化情况 | |||||
转让范围: | 推广形式: | 无 | |||
已转让企业数(个): | 0 |
联系方式 | |||||
联系人(平台): | 玉女士 | 联系人(平台)电话: | 0771-5885053 | ||
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成果简介 | |||||
1、课题来源与背景: 来源:2015海南省自然科学基金项目; 背景:经过多年的养殖,合浦珠母贝性状退化,个体小,死亡率高,迫切需要遗传改良。目前合浦珠母贝的基因资源十分缺乏,与性状关联的分子标记很少。 2、研究目的与意义: 本研究拟对合浦珠母贝转录组测序结果得到的SNP候选位点进行鉴定和分型,并与生长性状做关联分析,获得与之相关的SNP标记,从而推进合浦珠母贝遗传选育进程。 3、主要论点与论据: (1)从转录组测序结果中筛选出候选SNP位点。 (2)基于HRM技术对候选SNP位点进行鉴定和分型。 (3)SNP位点的生物信息学分析。 (4)SNP位点与生长性状(如壳长、绞合线长、壳宽、壳高、体重、壳干湿重、内脏团干湿重、壳厚、壳强度、闭壳肌拉力等)的关联分析。 4、创见与创新: 目前,合浦珠母贝遗传选育多依赖于表型性状。表型性状容易受到环境的影响。遗传信息是稳定的,可用于辅助选育。哪些SNP位点与性状相关,其分子机制是什么,值得关注。 5、社会经济效益,存在的问题: 本研究筛选出来的SNP位点可为合浦珠母贝生长、抗逆、繁育等性状解析和遗传选育研究奠定了一定的基础。 6、历年获奖情况: 获得2016年海洋科学技术奖二等奖一项。 喻达辉、范嗣刚、黄桂菊、郭奕惠、刘宝锁、陈明强、李有宁、吴开畅、张博、姜松,合浦珠母贝良种选育技术,国家海洋局,海洋科学技术奖,二等奖. 2016.4. 7、成果简介: 本项目顺利完成了各项指标。基于合浦珠母贝转录组数据鉴定出SNP位点250,324个,用HRM技术筛选出可用SNP位点203个,成功注释126个,其中包含一些与生长、抗逆、繁育等性状相关的功能基因。有6个SNP与合浦珠母贝生长性状相关。本研究发表论文3篇,其中SCI收录2篇,中文核心1篇。获得2016年海洋科学技术奖二等奖一项。 |